Петропавловский собор выступал в качестве некрополя Дома Романовых, созданного по образцу усыпальницы Московских великих князей и царей в Архангельском соборе и цариц - в Вознесенском монастыре Кремля. Первое достоверно известное захоронение в относится к 27 мая 1715 года, когда здесь в присутствии Петра I и Екатерины была погребена их 2-летняя дочь Наталия. В северо-восточной части собора появились в разное время могилы других умерших во младенчестве 5 детей Петра, в 1728 году- его дочери Анны. У входа в собор на месте будущего придела великомученицы Екатерины 7 января 1716 года предали земле тело царицы Марфы Матвеевны.
Под еще не достроенной колокольней в годы правления Петра I были погребены кронпринцесса Шарлотта София Кристина Вольфенбюттельская, жена царевича Алексея, сам убитый царевич и сестра императора, Мария Алексеевна. Гробы с телами скончавшегося 28 января 1725 года Петра I и его дочери Наталии, умершей 4 марта, были помещены внутрь строившегося храма во временную деревянную церковь. С 1727 года там же находился гроб с телом Екатерины I. Три гроба были преданы земле одновременно 29 мая 1731 года, по окончании строительных работ. Их поместили в общий склеп, сверху установили надгробия из белого алебастра. В 1732 года императрица Анна Иоанновна распорядилась снять имевшиеся в соборе саркофаги для их замены. В течение XVIII-XIX веков в соборе были похоронены все императоры и императрицы, за исключением Петра II и Иоанна VI. Прах Петра III по приказанию Павла I был перенесен из Александро-Невского монастыря в собор 5 декабря 1796 года и погребен одновременно с останками Екатерины II. В XIX веке для организации похорон указом создавалась «Печальная комиссия», которую возглавляли высшие придворные чины. Комиссия привлекала многих известных архитекторов и художников: Д. Трезини, М. Г. Земцова, А. Ф. Виста, А. Ф. Кокоринова, В. Бренна, Дж. Кваренги. Только Монферран четырежды оформлял собор (для похорон Александра I и Николая I, императриц Елизаветы Алексеевны и Марии Феодоровны). Церемония погребения сопровождалась пушечными выстрелами из крепости и перезвоном колоколов городских церквей. Члены Синода во главе с митрополитом С.-Петербургским встречали траурный кортеж у западных дверей собора. Катафалк обычно ставили в центральном нефе под балдахином, возвышавшимся до самого потолка. Перед гробом императора или императрицы помещали символы гос. власти. С 1831 года в соборе хоронили также великих князей, княгинь и княжон, церемониал при этом был более скромным. Могила представляла собою склеп (глубина 2,5 метра, длина 2,4 метра, ширина 1,2 метра), ее стены и дно выкладывались известняковыми плитами. Под основное погребение предварительно отдельно помещались сердце и внутренности. Гроб в медном ковчеге закрывался на замок, после погребения его засыпали песком. Могила покрывалась каменной плитой с надгробием: с 70-х XVIII века до 40-х годов XIX века - саркофаги серого рускеальского (карельского) мрамора без украшений. В марте 1865 году Александр II распорядился заменить пришедшие в ветхость надгробия. Мастерская Г. А. Балушкина по проекту архитектора Министерства императорского двора А. А. Пуаро, который в эти годы осуществлял в соборе надзор, и инженера Г. Е. Паукера к январю 1867 г года изготовила 15 новых гробниц - из белого итальянского (каррарского) мрамора. В июне 1867 года к гробницам были прикреплены (по углам саркофагов) двуглавые орлы, отлитые из бронзы и позолоченные, а также кресты. На чугунных решетках, окружавших саркофаги, и на стенах собора были укреплены бронзовые доски с текстами, составленными историком Устряловым. 15 гробниц (полые ящики, которые собирали в храме из 5 мраморных досок) изготовил купец 2-й гильдии Г. А. Балушкин. В дальнейшем большинство надгробий (всегo 30) создавалось по такому же образцу. В 1887 году Александр III пожелал заменить гробницы Александра II и его супруги, Марии Александровны, новыми. Надгробия из серо-зеленой алтайской яшмы и розового уральского орлеца - родонита весом 5,1 тонн и 6,7 тонн с резными крестами и орнаментами были изготовлены на Петергофской гранильной фабрике В 1907-1909 годах над могилами сестры Петра I, Марии Алексеевны, царевича Алексея и его супруги, расположенными под колокольней, установили новые мраморные плиты с бронзовыми крестами и с надписями. К 1917 году в храме находилось 41 захоронение. Почитанием в начале XX века пользовалась гробница императора Павла I. Надгробия украшали многочисленные реликвии: иконы в драгоценных окладах с лампадами, серебряные венки, знамена, памятные медали, пасхальные яйца и т. д. Так, на гробнице Петра I стоял образ апостола Петра работы Симона Ушакова в золотом окладе. На надгробии Александра II было 6 лампад, 3 подсвечника, 21 икона, 10 крестов, Евангелие, 8 медалей, 5 пасхальных яиц, 2 знамени - трофеи русско-турецкой войны, 165 серебряных венков, на надгробии Александра III - 25 лампад, 54 иконы, 674 венка.
В соборе, как в мемориале рус. военной славы, хранились трофеи Российской Армии: шведские знамена, взятые под Полтавой, а также во время других сражений Северной войны (ныне в Эрмитаже), польские, персидские, французские. штандарты, литавры, булавы. Адмиральский турецкий флаг, взятый в 1770 году, во время Чесменской битвы, императрица Екатерина II через 2 года собственноручно возложила на гробницу основателя русского флота - Петра I (оформление знамен в 1855 выполнил Огюст Монферран).
Источники:
https://www.pravenc.ru/text/2580504.html
