В конце июня 1941 года в Вилькии был создан штаб немецкого командования во главе с оберштурмфюрером СС Миссенбаумом. Немедленно был сформирован отряд белоповязочников. Его возглавлял судебный исполнитель Стасис Гудавичюс. 7-8 июля 1941 года, следуя приказу Миссенбаума, отряд белоповязочников арестовал около 150-200 мужчин-евреев. Большинство арестованных были доставлены в Каунас, а 21 еврей был расстрелян недалеко от Вилькии, недалеко от деревни Ягминишкес.
В августе 1941 года Вилькия стала одним из важнейших центров концентрации евреев в Каунасском регионе. Евреи из других районов были переселены в гетто Вилькии. “В лесу Пакаркле в Яучакяй (в 2 километрах от Вилькии) было совершено два массовых расстрела евреев. Первой была организованная операция по массовому убийству 28 августа 1941 года, в ходе которой были расстреляны 402 еврея, в том числе 76 мужчин, 192 женщины и 134 ребенка. Второе массовое убийство произошло в конце сентября 1941 года. 28 августа 1941 года Стасис Гудавичюс собрал членов своего подразделения (подразделения, находившегося под командованием немецкого командного пункта в Вилькии) и сказал им, что они должны перевезти евреев в лес Пакаркле в деревне Яучакяй, где были вырыты ямы. Там вооруженное подразделение из Каунаса должно было расстрелять евреев. Из Каунаса быстро прибыли два грузовика с примерно 25-30 – по другим данным, около 40 – военнослужащими из 3-го подразделения 1-го батальона (под командованием майора Казиса Шимкуса), которым командовали лейтенант Юозас Барзда и лейтенант Брониус Норкус. Уорент-офицером был Зигмас Арлаускас. Когда они прибыли, на месте происшествия уже находились 2-3 немецких офицера и несколько немецких военнослужащих. Сотрудники подразделения командного пункта и полиции Вилкии охраняли евреев, содержавшихся в Вилкийской синагоге. Вместе с бойцами батальона они вывели из синагоги около 400 еврейских мужчин, женщин и детей и провели их колонной к месту массового убийства. Некоторые военнослужащие из подразделения Вилкия окружили это место и охраняли его, в то время как другие подводили евреев группами к краю ямы и заставляли их выстраиваться в линию. Норкус отдал команду всем солдатам 3-го подразделения расстреливать евреев. Солдаты из подразделения Вилкия сбросили убитых в яму.
Однажды утром в конце сентября 1941 года около 20 военнослужащих из 3-го подразделения 1-го батальона и 3-4 немецких офицера прибыли в синагогу Вилькия, где содержались евреи. До их прибытия уже собрались члены подразделения командного пункта в Вилькии под командованием С. Гудавичюса. Начальник службы безопасности Вилкии Микелионис также был на месте происшествия. Члены подразделения "Вилкия" и военнослужащие 1-го батальона начали выводить женщин и детей из синагоги в соответствии с именами, указанными в списке. Они заставили их выстроиться в ряды по шесть человек. Они привели евреев к месту массового убийства, где была подготовлена яма. Гудавичюс, Микелионис и немецкие офицеры прибыли на место на машине. Они приказали солдатам батальона и некоторым членам подразделения "Вилкия" приблизиться к краю ямы, а оставшимся силам охранять евреев. Евреям было приказано раздеться и сдать все ценные вещи. Затем они группами повели их к месту съемок. Гудавичюс, Микелионис и немецкие офицеры отдали приказ открыть огонь по военнослужащим батальона и членам подразделения "Вилкия". Они убивали евреев с 8:30 утра до 13:00.
4 декабря 1945 года, согласно информации, содержащейся в документах председателя Вилкийского исполнительного комитета Скаудиса и его заместителей Арманиса и Бержанскаса, в братской могиле в лесу Пакаркле в деревне Яучакяй было найдено до 800 жертв убийств, похороненных в братской могиле в лесу Пакаркле в деревне Яучакяй. В 1958 году останки советских активистов, коммунистов, евреев и других лиц из Велюонского, Середжиусского и Чекиского районов, убитых в период с 1941 по 1945 год, были перевезены в братскую могилу в лесу Пакаркле в Яучакяй. Останки около 3500 человек были похоронены в общей могиле.
Источники: